Οι σκοποί του Συνδέσμου είναι:
• Η προβολή και προώθηση θεμάτων, που αφορούν στην ανάπτυξη της παραγωγής, της διακίνησης και της εμπορίας προϊόντων ζωικής προέλευσης και θεμάτων, που αφορούν στα αγροτικά ζώα.
• Η μελέτη προβλημάτων και θεμάτων, η χρήση μεθόδων έρευνας και τεχνολογίας και γενικά κάθε μέσου για την επίτευξη της μεγίστης παραγωγής και αρίστης ποιότητας των προϊόντων του κλάδου, καθώς και για την καλλίτερη γνώση των κανόνων της αγοράς.
• Η προβολή των προϊόντων του κλάδου τόσο στην εσωτερική αγορά, όσο και στις άλλες αγορές. Η συμβολή στην χάραξη μιας εθνικής πολιτικής για τα προϊόντα του κλάδου με ιδιαίτερη έμφαση στα προϊόντα ονομασίας προελεύσεως και ειδικά στο τυρί «φέτα».
• Η προάσπιση των όρων που επιφυλάσσονται για τα προϊόντα του κλάδου ενώπιον των ελληνικών και κοινοτικών αρχών, ως και των αρμόδιων αρχών άλλων χωρών.
• Η προώθηση μέτρων για την προστασία του περιβάλλοντος, της ιστορικής, και πολιτιστικής κληρονομιάς στον τομέα της κτηνοτροφίας, ηθών και εθίμων, μέσω εκδηλώσεων επιμόρφωσης και ενημέρωσης, ανάληψης δραστηριοτήτων, εκπόνησης προγραμμάτων και μελετών, στο πλαίσιο των σκοπών του Συνδέσμου και της κείμενης νομοθεσίας.
• Η συνεργασία με τις κοινοτικές και διεθνείς οργανώσεις του κλάδου, με σκοπό την προαγωγή των συμφερόντων του.
• Η συμμετοχή σε θεσμούς, συλλογικές οργανώσεις, διεπαγγελματικές οργανώσεις, οι οποίες λειτουργούν σύμφωνα με τις διατάξεις της εθνικής και κοινοτικής νομοθεσίας και γενικά σε ν.π.ι.δ. και ν.π.δ.δ., που στοχεύουν στην ανάπτυξη των κτηνοτροφικών προϊόντων προς το συμφέρον του κλάδου.